Pruebas genómicas ultrarrápidas en bebés y niños críticamente enfermos con sospecha de condiciones monogénicas

Pruebas genómicas ultrarrápidas en bebés y niños críticamente enfermos con sospecha de condiciones monogénicas

Este estudio sugiere la viabilidad de pruebas genómicas ultrarrápidas en pacientes pediátricos en estado crítico con sospecha de condiciones monogénicas en el sistema de salud pública australiano. Sin embargo, se necesita más investigación para comprender el valor clínico de tales pruebas y la generalización de los hallazgos a otros entornos de atención médica.

La adopción generalizada de pruebas genómicas rápidas en la atención crítica pediátrica requiere guías clínicas y de laboratorio sólidas que brinden un servicio equitativo y consistente en todos los sistemas de atención médica.

Objetivo: Evaluar prospectivamente el desempeño de una red multicéntrica para el diagnóstico genómico ultrarrápido en un sistema público de salud.

Diseño, entorno y participantes: Estudio de viabilidad descriptivo de pacientes pediátricos en estado crítico con sospecha de condiciones monogénicas tratados en 12 hospitales australianos entre marzo de 2018 y febrero de 2019, con datos recopilados hasta mayo de 2019. Se utilizó una estrategia de implementación formal que enfatiza la comunicación y la retroalimentación, procesos estandarizados, coordinación, distribución del liderazgo y aprendizaje colectivo para facilitar la adopción.

Exposiciones: Secuenciación de exoma ultrarrápida.

Principales resultados y medidas: El resultado primario fue el tiempo desde la recepción de la muestra hasta el informe de secuenciación del exoma ultrarrápido. Los resultados secundarios fueron el rendimiento diagnóstico molecular, el cambio en el manejo clínico después del informe de secuenciación del exoma ultrarrápido, el tiempo desde el ingreso hospitalario hasta el informe de laboratorio y la proporción de informes de laboratorio devueltos antes de la muerte o el alta hospitalaria.

Resultados: La población de estudio incluyó 108 pacientes con una mediana de edad de 28 días (rango, 0 días a 17 años); el 34% eran mujeres; y el 57% estaban en unidades de cuidados intensivos neonatales, el 33% en unidades de cuidados intensivos pediátricos y el 9% eran de otras salas de hospitales. El tiempo medio desde la recepción de la muestra hasta el informe de secuenciación del exoma ultrarrápido fue de 3,3 días (IC del 95%, 3,2-3,5 días) y el tiempo medio fue de 3 días (rango, 2-7 días). El tiempo promedio desde el ingreso hospitalario hasta el informe de secuenciación del exoma ultrarrápido fue de 17.5 días (IC 95%, 14.6-21.1 días) y se emitieron 93 informes (86%) antes de la muerte o el alta hospitalaria. Se estableció un diagnóstico molecular en 55 pacientes (51%). Once diagnósticos (20%) resultaron del uso de los siguientes enfoques para aumentar el análisis estándar de secuenciación del exoma: análisis de secuenciación del genoma mitocondrial, análisis de número de copias basado en la secuenciación del exoma, uso de bases de datos internacionales para identificar nuevas asociaciones de enfermedades genéticas y análisis adicional de fenotipos y ARN. En 42 de 55 pacientes (76%) con diagnóstico molecular y en 6 de 53 pacientes (11%) sin diagnóstico molecular, se consideró que el resultado de la secuenciación rápida del exoma influyó en el manejo clínico. Los tratamientos dirigidos se iniciaron en 12 pacientes (11%), el tratamiento se redirigió hacia los cuidados paliativos en 14 pacientes (13%) y se inició la vigilancia de complicaciones específicas en 19 pacientes (18%).

Conclusiones y relevancia: Este estudio sugiere la viabilidad de pruebas genómicas ultrarrápidas en pacientes pediátricos en estado crítico con sospecha de condiciones monogénicas en el sistema de salud pública australiano. Sin embargo, se necesita más investigación para comprender el valor clínico de tales pruebas y la generalización de los hallazgos a otros entornos de atención médica.