Evidencia genómica de la reinfección con SARS-CoV-2: estudio de caso

Evidencia genómica de la reinfección con SARS-CoV-2: estudio de caso

Cronograma de aparición de síntomas, diagnóstico molecular y secuenciación de muestras.

La discordancia genética de las dos muestras de SARS-CoV-2 fue mayor de lo que podría explicarse por la evolución in vivo a corto plazo. Estos hallazgos sugieren que el paciente fue infectado por SARS-CoV-2 en dos ocasiones distintas por un virus genéticamente distinto. Por lo tanto, la exposición previa al SARS-CoV-2 podría no garantizar la inmunidad total en todos los casos.

 

The Lancet Infectious Diseases, 12/10/2020Genomic evidence for reinfection with SARS-CoV-2: a case study”.

Actualmente se desconoce el grado de inmunidad protectora conferida por la infección por el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2). Por lo tanto, no se comprende bien la posibilidad de reinfección con SARS-CoV-2. Describimos una investigación de dos casos de infección por SARS-CoV-2 en el mismo individuo.

Métodos: Un hombre de 25 años que era residente del condado de Washoe en el estado estadounidense de Nevada se presentó a las autoridades de salud en dos ocasiones con síntomas de infección viral, una vez en un evento de prueba comunitaria en abril de 2020, y una segunda vez en atención primaria y luego en el hospital a fines de mayo y principios de junio de 2020. Se obtuvieron hisopos nasofaríngeos del paciente en cada presentación y dos veces durante el seguimiento. Se realizaron pruebas de amplificación de ácidos nucleicos para confirmar la infección por SARS-CoV-2. Hicimos una secuenciación de próxima generación de SARS-CoV-2 extraído de hisopos nasofaríngeos. Los datos de la secuencia se evaluaron mediante dos metodologías bioinformáticas diferentes. Se utilizó un marcador de repetición en tándem corto para el análisis de fragmentos para confirmar que las muestras de ambas infecciones provenían del mismo individuo.

Resultados: El paciente tuvo dos pruebas positivas para SARS-CoV-2, la primera el 18 de abril de 2020 y la segunda el 5 de junio de 2020, separadas por dos pruebas negativas realizadas durante el seguimiento en mayo de 2020. El análisis genómico de SARS- CoV-2 mostró diferencias genéticamente significativas entre cada variante asociada con cada caso de infección. La segunda infección fue sintomáticamente más grave que la primera.

Interpretación: La discordancia genética de las dos muestras de SARS-CoV-2 fue mayor de lo que podría explicarse por la evolución in vivo a corto plazo. Estos hallazgos sugieren que el paciente fue infectado por SARS-CoV-2 en dos ocasiones distintas por un virus genéticamente distinto. Por lo tanto, la exposición previa al SARS-CoV-2 podría no garantizar la inmunidad total en todos los casos. Todas las personas, ya sean diagnosticadas previamente con COVID-19 o no, deben tomar las mismas precauciones para evitar la infección por SARS-CoV-2. Las implicaciones de las reinfecciones podrían ser relevantes para el desarrollo y la aplicación de vacunas.

Fondos: Nevada IDEA Network of Biomedical Research, y el National Institute of General Medical Sciences (National Institutes of Health).